Métodos de simulación QM/MM y de mecánica estadística: una aproximación teórica a la biología molecular.

Abstract

Resumen: Los avances técnicos y metodológicos en el campo de la química teórica y la enzimología computacional han ampliado considerablemente el espectro de aplicaciones y la precisión en las predicciones de los métodos in silico. En este sentido, las técnicas híbridas de mecánica cuántica/mecánica molecular (QM/MM) juntamente con los métodos de mecánica estadística han contribuido decisivamente al estudio de diversos mecanismos de catálisis enzimática y de reconocimiento enzima-ligando. En este artículo se revisa el desarrollo de dichas técnicas y su impacto en la biología molecular.
Palabras clave: Enzimología computacional, dinámica molecular, QM/MM, química teórica, mecanismo enzimático.
Abstract: Technical and methodological advances in the field of theoretical chemistry and computational enzymology have greatly expanded the range of applications and predictive accuracy of in silico methods. In this sense, hybrid techniques of quantum mechanics/molecular mechanics (QM/MM) together with statistical mechanics methods have contributed decisively to the study of enzymatic reaction mechanisms and enzyme-ligand recognition. This article reviews the development of these techniques and their impact on molecular biology.
Keywords: Computational enzymology, molecular dynamics, QM/MM, theoretical chemistry, enzyme mechanism.